本會係由台北、彰化、南投、雲林、嘉義、台南縣及台中市等七縣市獸醫師公會發起籌組，並於民國五十八年十月二十八日正式成立。公會的第一任理事長為陳登訓君，其後繼任者為黃清芳君、王銘堪君、陳秋麟君、劉清風君、林木川君、洪博文君、現任理事長為李建裕君。諸位先進及歷屆理、監事，對公會的會務推展，皆不遺餘力，無論在制度上的建立、醫療及防治服務的推廣教育上，都卓然有成，供獻良多，使公會的會務與業務日益茁壯。近年來，國內社會安定、經濟繁榮，，而動物的繁衍受外來惡性傳染病的侵擾，日益增多，亟須獸醫師提供更多及更佳的專業服務。然對獸醫師而言，社會日增的需求，也構成一種新的挑戰，吾等獸醫師應如何提高醫療水準及專業道德，以加強服務社會，實是當務之急。

本會會員人數激增，目前已達三、四四○人，為因應醫療防治業務增加及獸醫科技之進步，使獸醫同仁間有進一步加強聯繫及吸取新知之必要，於七十二年十二月一日出版會刊（自九十年起改由中華民國獸醫師公會全國聯合會出版）；每半年並由各縣市獸醫師公會輪流舉辦本會暨各縣市公會之聯誼會議，藉以增進會務之推展及交換研習之機會。

為發展國民外交及促進國際間民間社團之交流活動，本會於民國六十八年一月十三日與日本靜岡縣獸醫師會締結為姐妹會，中日雙方均曾組團拜訪交流。

本會暨本省各縣市獸醫師公會成立歷史已近三十餘年，由於各位先進同仁努力，已為會務奠定堅實的基礎，期盼獸醫同仁賡續奮進，邁向世紀開闊的地球村。